Sophie Gerber
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Résumé
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Adresse |
Image : Lokz Phoenix |
Mots Clés
Génétique des
plantes - Génétique des populations - Flux de gènes - Arbres
forestiers - Évolution - Marqueurs génétiques - Cartographie génétique
- QTL -
Philosophie et histoire de la biologie
Formation
♦
Master LoPhiSC,
Université Paris 1 Sorbonne, philosophie des sciences (2013)
♦ Habilitation à diriger des recherches de l'Université
de
Bordeaux (2006)
♦ Docteur de l'Institut
National
Agronomique Paris-Grignon (1992)
♦ Ingénieure de l'INA
P.G. (promotion 1986)
Parcours professionnel
▪ Août 2000 – aujourd'hui : chargée
de recherche Inra UMR
Biogeco
(Inra Université
de
Bordeaux)
▪
1998-2000 : Détachée dans l'équipe
de génétique et d'amélioration des arbres forestiers (Inra)
Cestas
▪
1994-1998 : Maître de Conférences
en génétique végétale École
Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse
▪
1992-1994 : Assistante Temporaire
d'Enseignement et de Recherche Université Paris XI,
Laboratoire ESE
▪ 1989-1992, Thèse de doctorat.
Laboratoire d'Amélioration des Arbres Forestiers (Inra), Cestas
Implications
♣ Membre du groupe Inra
Sciences
en
questions
♣ Membre de
l'Institut pour
la Philosophie dans la Biologie et la Médecine, PhilInBioMed
♣ Membre
du comité de déontologie de l'Anses
Réalisations
Chic botanique
performance réalisée dans le cadre d'un appel à projets arts et
sciences de l'Université de Bordeaux, « intelligence des
plantes ».
Film de présentation - Spectacle complet
2019 - 2020
Projet imaginé par Kenza Afsahi,
sociologue, Université de Bordeaux, Sophie Gerber et Thierry
Poquet, metteur en scène.
Quatre semaines de résidence artistique (avril-novembre 2019).
Avec sur scène Mareike
Franz, danseuse, Valérie
Philippin, chanteuse, Anne Juquel, comédienne, Sophie Gerber,
Thierry Poquet.
Quatre représentations, Festival
Facts, Talence, 22-23 novembre 2019, plus de 200 spectateurs.
Une
représentation à Villeneuve d'Ascq en octobre 2020.
Publications
● Gerber S., Benharrech S. 2024 « Je considère un arbre » : manifeste de Martin Buber pour un dialogue avec l’arbre. Revue Forestière Française 75(3), https://hal.inrae.fr/hal-04688303 pdf
● Gerber S. 2024. Les plantes sont-elles "à notre service" ? Comment des images et des mots, associés dans les sphères de la biologie, illustrent une certaine relation au végétal. Revue Essais, 21. http://journals.openedition.org/essais/13421 DOI pdf
● Gerber S., Mariette S. 2023. Les marqueurs du vivant. Terrestres. https://www.terrestres.org/2023/10/25/les-marqueurs-du-vivant/ pdf
● Gerber S., Mariette S., Santolini J. 2023. Manifeste pour des savoirs sauvages. lundimatin. https://lundi.am/Manifeste-pour-des-savoirs-sauvages pdf
●
Gerber S., Noûs C. 2023. Pensée
végétale et simiesque, liens entre vivants. Arts et
sciences, volume 7 (2). Feuilleter
en ligne. pdf
● Gerber S. 2022. Préface à l'ouvrage de Petit E., « Science et émotion - Le rôle de l'émotion dans la pratique de la recherche » Éditions Quæ, Collection Sciences en questions.
● Gerber S., Hiernaux Q. 2022 Plants as machines: history, philosophy and practical consequences of an idea. Journal of Agricultural and Environmental Ethics. pdf
● Leroy T., Gerber S. 2021 « Arbres et forêts, entre corps et cœurs » The Conversation. https://theconversation.com/arbres-et-forets-entre-corps-et-coeurs-170331 pdf
●
Gerber S. 2021. Traduction, chapitre V, Agnes Arber «
The natural philosophy of plant form » « La philosophie
naturelle de la forme végétale » Cambridge University Press,
1950. Dans Philosophie du végétal, Textes
Clés, Hiernaux Q. (ed), Éditions Vrin, Paris. pdf
● Gerber S. 2020. Préface à l'ouvrage de Hiernaux Q., « Du comportement végétal à l’intelligence des plantes ? » Éditions Quæ, Collection Sciences en questions.
● Le groupe Sciences en questions : un espace de réflexion sur les sciences à l’Inra Natures Sciences Sociétés, novembre 2018, https://doi.org/10.1051/nss/2018046 pdf
●
Gerber
S.
2018. An
herbiary of plant individuality. PTPBio, Philosophy, Theory,
and Practice in Biology, Volume 10 (5)
http://dx.doi.org/10.3998/ptpbio.16039257.0010.005
pdf
Les espèces de l'herbiaire
(Tableau 6, page 15) sont
ici.
● Gerber S. 2018 « Les plantes cultivées cachent-elles la forêt ? » in Hiernaux Q., Timmermans B. (eds), Philosophie du végétal, Paris, Vrin - Annales de l’institut de philosophie de l’université de Bruxelles, ISBN 978-2-7116-2834-6 : 91-114. Texte pdf
●
Gerber S. 2017 « Une plante est
un individu » : vérité, exactitude ou abus de langage ?
Cahiers
Art
et Science, Numéro spécial 9 - revue annuelle.
Langage, vérité, exactitude. Pages 121-128. Éditions confluences,
Bordeaux. ISBN : 978-2-35527-2097 pdf
●
Barret
P.,
Bourguet D., Duée PH., Gerber S., Le Roux X., Tixier-Boichard M.
2016. Regards. Éthique et biodiversité: questions posées à et
par la recherche agronomique. Nature Science Société.
http://dx.doi.org/10.1051/nss/2016029 pdf
● Sinclair F.H., Stone G., Nicholls J., Cavers S., Gibbs M., Butterill P., Wagner S., Ducousso A., Gerber S., Petit R.J., Kremer A., Schönrogge K. 2015 Impacts of local adaptation of forest trees on associations with herbivorous insects: implications for adaptive forest management. Evolutionary Applications 8(10), 972–987, doi:10.1111/eva.12329 pdf
● Antonecchia G., Fortini P., Lepais O., Gerber S., Léger P., Scippa G. S., Viscosi V. 2015 Genetic structure of a natural oak community in central Italy: Evidence of gene flow between three sympatric white oak species (Quercus, Fagaceae) Annals of Forest Research 58(2) doi:10.15287/afr.2015.415 pdf
● Wagner S., Gerber S., Liepelt S., Petit R.J. 2015 Within-range translocations and their consequences in European larch. PLoS ONE doi:10.1371/journal.pone.0127516 pdf
● Nardin M., Musch B., Rousselle Y., Guérin V., Sanchez L., Rossi J.-P., Gerber S., Marin S., Pâques L.E., Rozenberg P. 2015 Genetic differentiation of European larch along an altitudinal gradient in the French Alps. Annals of Forest Science doi:10.1007/s13595-015-0483-8 pdf
● Gerber S., Chadœuf J. Gugerli F.,Lascoux M., Buiteveld J., Cottrell J., Dounavi A., Fineschi S., Forrest L.L., Fogelqvist J., Goicoechea P.G., Jensen J.S., Salvini D., Vendramin G.G., Kremer A. 2014 High rates of gene flow by pollen and seed in oak populations across Europe. PLoS ONE 9(1): e85130. doi:10.1371/journal.pone.0085130 pdf
● Lepais O., Roussel G., Hubert F., Kremer A., Gerber S., 2013. Strength and variability of postmating reproductive isolating barriers between four European white oak species. Tree Genetics & Genomes 9, 841-853.
● Wagner S., Gerber S., Petit R.J. 2012. Two highly informative dinucleotide SSR multiplexes for the conifer Larix decidua (European larch). Molecular Ecology Resources 12: 717-725.
● Piotti A., Leonardi S., Buiteveld J., Geburek T., Gerber S., Kramer K., Vettori C., Vendramin G.G. 2011. Comparison of pollen gene flow among four European beech (Fagus sylvatica L.) populations characterized by different management regimes. Heredity DOI: 10.1038/hdy.2011.77
● Lepais O., Gerber S., 2011. Reproductive patterns shape introgression dynamics and species succession within the European white oak species complex. Evolution 65 (1): 156–170. DOI: 10.1111/j.1558-5646.2010.01101.x
● Wernsdörfer H., Caron H., Gerber S., Cornu G., Rossi V., Mortier F., Gourlet-Fleury S. 2009. Relationships between demography and gene flow and their importance for the conservation of tree populations in tropical forests under selective felling regimes. Conservation Genetics: 1-15. DOI: 10.1007/s10592-009-9983-0
● Viscosi V., Lepais O., Gerber S., Fortini P. 2009. Leaf morphological analyses in four European oak species (Quercus) and their hybrids: A comparison of traditional and geometric morphometric methods. Plant Biosystems 143(3): 575 - 587.
● Di Vecchi Staraz M., Laucou V., Boursiquot J.-.M., Lacombe T., Varès D., Gerber S., Boselli M., This P., 2009. The kingroup of the cultivar 'Chardonnay' revealed. Acta Hort. (ISHS) 827: 233-238.
● Di Vecchi Staraz M., Bruno G., Ortigosa P., Laucou V., Lacombe T., Varès D., Gerber S., Boselli M., This P., 2009. Evidence of gene flow between wild and cultivated grapevine (Vitis vinifera l.) in France . Acta Hort. (ISHS) 827: 103-106.
● Lepais O., Petit R.J., Guichoux E., Lavabre J.E., Alberto F., Kremer A., Gerber S., 2009. Species relative abundance and direction of introgression in oaks. Molecular Ecology 18 (10): 2228-2242 (Article faisant l'objet dans le même numéro d'une "News and views - Perspective", Alex Buerkle C. Ecological context shapes hybridization dynamics, 2077-2079), recommandé par "Faculty of 1000", un paragraphe dans "Editorial and retrospective" consacré à l'article, premier numéro de Mol Ecol 2010.
● Di Vecchi-Staraz M., Laucou V., Bruno G., Lacombe T., Gerber S., Bourse T., Boselli M., This P., 2009. Low level of pollen-mediated gene flow from cultivated to wild grapevine: consequences for the evolution of the endangered subspecies Vitis vinifera L. subsp. silvestris. Journal of Heredity 100(1): 66-75.
● Fernandes L., Rocheta M., Cordeiro J., Pereira S., Gerber S., Oliveira M.M., Ribeiro M.M., 2008. Paternity analysis and mating system in a Pinus pinaster Aiton clonal seed orchard using microsatellites. Annals of Forest Science 65 (7): 706.
● Kumar S., Gerber S., Richardson T.E. 2007. Testing for non-random contribution of pollen parents using microsatellites and chloroplast markers in polycross families of Pinus radiata D. Don. Tree Genetics & Genomes 3: 207-214.
● Lepais O., Léger V., Gerber S. 2006. High throughput microsatellite genotyping in oak species. Silvae Genetica 55 (4-5): 238-240.
● González-Martínez S.C., Gerber S., Cervera M.T., Martínez-Zapater J.M., AlíaR., Gil L. 2003. Selfing and sibship structure in a two-cohort stand of maritime pine (Pinus pinaster Ait.) using nuclear SSR markers. Ann. For. Sci. 60: 115–121.
●
Chaix
G.,
Gerber
S.,
Razafimaharo V., Vigneron P., Verhaegen D., Hamon S. 2003. Gene
flow estimation with microsatellites in a Malagasy seed orchard
of Eucalyptus grandis. Theor. Appl. Genet.107: 705–712.
● Goffinet B., Gerber S., 2000. Quantitative trait loci: a meta-analysis, Genetics 155: 463-473
● Lexer C., Heinze B., Gerber S., Kampfer-Macalka S., Steinkellner H., Kremer A., GlösslJ., 2000. Microsatellite analysis of maternal half-sib families of Quercus robur, pedunculate oak (II): Inferring the number of pollen donors from the offspring. Theor. Appl. Genet. 100: 858-865
● de Vienne D., Burstin J., Gerber S., Leonardi A., Le Guilloux M., Murigneux A., Beckert M., Bahrman N., Damerval C., Zivy M., 1996. Two-dimensional electrophoresis of proteins as a source of monogenic, codominant markers for population genetics and mapping the expressed genome. Heredity (76): 166-177.
● Gerber S., Rodolphe F., Bahrman N., Baradat P., 1993. Seed protein variations of a pine (Pinus pinaster Ait) revealed by two-dimensional electrophoresis: genetic determinism and construction of a linkage map. Theor. Appl. Genet. 85: 521-528.
● Imberty A., Gerber S., Tran V., Perez S., 1990. Data bank of Three-dimensional structures of disaccharides, a tool to build 3-D structures of oligosaccharides. Glycoconjugate Journal 7: 27-54.
Mémoire
Gerber S., 2013.
Individualité végétale, Mémoire, master 2 LoPhiSC,
Université Panthéon Sorbonne (Paris 1), Université Paris
Sorbonne (Paris 4). lien
pdf
Logiciel
FaMoz,
un logiciel pour les reconstructions de parenté.
Logiciel écrit dans les langages C et TclTk,
avec l'aide de Patrick Chabrier
(Inra, Biometrie Intelligence Artificielle, Toulouse), qui
utilise les calculs de vraisemblances et les simulations
pour réaliser des recherches de parenté, à partir de
marqueurs codominant, dominants et cytoplasmiques
(voir Gerber et al. 2000b, Gerber et al. 2003).
Le logiciel FaMoz, un acronyme pour "Father/Mother", est
librement disponible
sur internet.
Dernière mise à jour novembre 2023
